Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD12P35452 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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