Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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HOXD8P13378 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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HOXD8P13378 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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HOXD8P13378 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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HOXD8P13378 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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