Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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