Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms