Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms