Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms