Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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