Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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