Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms