Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms