Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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