Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms