Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TMPOP42166 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms