Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms