Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms