Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C10orf55Q5SWW7 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms