Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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