Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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