Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms