Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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