Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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CDH18Q13634 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CDH18Q13634 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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