Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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