Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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