Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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