Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms