Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ARID4AP29374 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms