Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLDN9O95484 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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