Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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