Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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