Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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