Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
R3HDM1Q15032 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms