Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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