Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SGCGQ13326 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SGCGQ13326 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SGCGQ13326 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SGCGQ13326 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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