Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
KDM5AP29375 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KDM5AP29375 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms