Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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