Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms