Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDGFRLQ15198 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms