Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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