Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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