Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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