Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTP4A2Q12974 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTP4A2Q12974 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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