Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms