Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms