Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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