Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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USP35Q9P2H5 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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USP35Q9P2H5 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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USP35Q9P2H5 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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USP35Q9P2H5 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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