Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms