Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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