Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms