Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IMPG1Q17R60 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms