Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms